More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1887 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 373 aa  759    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  60.86 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  36.05 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  36.05 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.05 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.5 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.2 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  32.6 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  36.71 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  33.99 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  32.23 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.83 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.93 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.62 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.22 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.23 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.23 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  31.78 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  33.83 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  31.78 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  31.83 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  31.77 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  31.74 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.83 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  32.12 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1740  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.84 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.01 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.94 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  33.15 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.44 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.34 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.61 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  30.86 
 
 		 377 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.61 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.15 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  32.55 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.33 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0567  aminotransferase, class V  32.37 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.358497  hitchhiker  0.00213924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.94 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.96 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.33 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1737  aminotransferase, class V  32.83 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347432  hitchhiker  0.00095198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  31.18 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.22 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.92 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.92 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.34 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.51 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.97 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  32.13 
 
 		 382 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1557  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.899194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  30.38 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.56 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.32 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.35 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  29.24 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.3 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.36 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  29.46 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.76 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  28.36 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.36 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.28 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.47 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.18 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.06 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  30.95 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  29.91 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  29.71 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  31.04 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  31.44 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  29.71 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  30.37 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  30.75 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  28.15 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  29.28 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  30.28 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.32 
 
 		 377 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  28.93 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  29.6 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  27.7 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  31.82 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  28.86 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  28.9 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  29.57 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  29.19 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  28.86 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  29.74 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  30.38 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.35 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.17 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  31.47 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  29.74 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  28.11 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>