More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1557 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1557  aminotransferase class V  100 
 
 
336 aa  671    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.899194  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1737  aminotransferase, class V  78.87 
 
 
339 aa  556  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347432  hitchhiker  0.00095198 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1740  aminotransferase, class V  78.87 
 
 
336 aa  555  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0567  aminotransferase, class V  76.12 
 
 
336 aa  541  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.358497  hitchhiker  0.00213924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  47.41 
 
 
347 aa  291  9e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  34.21 
 
 
362 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  34.5 
 
 
362 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.92 
 
 
362 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.78 
 
 
384 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.85 
 
 
381 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  31.75 
 
 
373 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  29.04 
 
 
372 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.34 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  31.27 
 
 
360 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.86 
 
 
384 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  37.5 
 
 
379 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  31.59 
 
 
388 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  31.82 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.79 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  27.48 
 
 
384 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  27.48 
 
 
384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  32.86 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  30.88 
 
 
383 aa  132  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  27.86 
 
 
387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.25 
 
 
387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.07 
 
 
385 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  27.87 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.41 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  28.57 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  35.14 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  30.92 
 
 
385 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 
382 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  29.2 
 
 
384 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.82 
 
 
384 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  28.94 
 
 
386 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  28.24 
 
 
382 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  30.71 
 
 
382 aa  123  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  28.24 
 
 
382 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.9 
 
 
360 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  27.54 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  27.12 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  29.68 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.49 
 
 
380 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  28.49 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30.27 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  29.89 
 
 
382 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.98 
 
 
383 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  26.63 
 
 
374 aa  116  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  29.6 
 
 
381 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  29.5 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  29.89 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  27.64 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  28.32 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  31.12 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  28.03 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  29.36 
 
 
389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  29.48 
 
 
382 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  27.57 
 
 
380 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  27.99 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  27.56 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.39 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  30.23 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.45 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  29.41 
 
 
380 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  29.57 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  26.74 
 
 
398 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  27.17 
 
 
382 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  28.28 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  28.12 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.11 
 
 
355 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  27.92 
 
 
355 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  26.72 
 
 
421 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  29.24 
 
 
398 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  32.95 
 
 
355 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  27.96 
 
 
338 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  29.14 
 
 
387 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  29.02 
 
 
401 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  28.77 
 
 
422 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  27.75 
 
 
356 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  27.87 
 
 
373 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  25.71 
 
 
356 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.41 
 
 
400 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.63 
 
 
357 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  27.64 
 
 
402 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  29.66 
 
 
396 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  30.89 
 
 
389 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  27.64 
 
 
402 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  27.75 
 
 
356 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  23.71 
 
 
381 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  31.52 
 
 
415 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  27.35 
 
 
402 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.86 
 
 
396 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  28.98 
 
 
394 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>