More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0567 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0567  aminotransferase, class V  100 
 
 
336 aa  675    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.358497  hitchhiker  0.00213924 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1737  aminotransferase, class V  77.31 
 
 
339 aa  546  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347432  hitchhiker  0.00095198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1557  aminotransferase class V  76.12 
 
 
336 aa  541  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.899194  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1740  aminotransferase, class V  73.27 
 
 
336 aa  525  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  47.69 
 
 
347 aa  299  5e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.99 
 
 
384 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  32.37 
 
 
373 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  32.07 
 
 
372 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.03 
 
 
381 aa  159  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  30.35 
 
 
385 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.98 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.59 
 
 
387 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.81 
 
 
362 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.9 
 
 
387 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  34.04 
 
 
377 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  33.14 
 
 
360 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  30.34 
 
 
387 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.58 
 
 
386 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  30.81 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.34 
 
 
363 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  28.81 
 
 
384 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  28.81 
 
 
384 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  31.44 
 
 
382 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  29.43 
 
 
360 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  30.84 
 
 
389 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.17 
 
 
388 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  31.55 
 
 
383 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  30.88 
 
 
384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.09 
 
 
384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.55 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  32.75 
 
 
383 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  31.05 
 
 
379 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  29.94 
 
 
385 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  28.98 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  29.68 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  29.23 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  30.9 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.65 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  31.88 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.32 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.32 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  30 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  28.32 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.05 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.75 
 
 
384 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  28.61 
 
 
382 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  31.83 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.16 
 
 
384 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.94 
 
 
383 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.27 
 
 
382 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.21 
 
 
395 aa  126  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  28.32 
 
 
382 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  28.01 
 
 
379 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  27.64 
 
 
382 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  27.02 
 
 
356 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  28.77 
 
 
379 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  28.05 
 
 
382 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  28.98 
 
 
355 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  27.79 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.2 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.53 
 
 
382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  26.84 
 
 
382 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  28.99 
 
 
391 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  28.4 
 
 
374 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  29.49 
 
 
394 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  27.25 
 
 
379 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  28.29 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  26.78 
 
 
380 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  29.94 
 
 
398 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  29.15 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  27.48 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  28.37 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.29 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.29 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.29 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.29 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.29 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  30.29 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  26.33 
 
 
380 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.66 
 
 
355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  27.64 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  28.81 
 
 
357 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  28.21 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  28.53 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  28.65 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  29.02 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  27.7 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  29.81 
 
 
363 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  28.53 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  28.21 
 
 
402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  28.61 
 
 
360 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  26.32 
 
 
380 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.48 
 
 
400 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5997  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  27.53 
 
 
355 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.762607  normal  0.379829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  31.2 
 
 
391 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4247  aminotransferase, class V  28.74 
 
 
354 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4119  aminotransferase, class V  28.74 
 
 
354 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142749  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  27.92 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  26.8 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>