More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1737 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1737  aminotransferase, class V  100 
 
 		 339 aa  679    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347432  hitchhiker  0.00095198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1557  aminotransferase class V  78.87 
 
 		 336 aa  556  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.899194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1740  aminotransferase, class V  77.08 
 
 		 336 aa  545  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0567  aminotransferase, class V  77.31 
 
 		 336 aa  546  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.358497  hitchhiker  0.00213924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  47.83 
 
 		 347 aa  295  6e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  33.99 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.33 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  32.83 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.75 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.6 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  30.61 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  34.93 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.09 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.78 
 
 		 388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  27.89 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.71 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.71 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  27.89 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  31.01 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  30.34 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  30.9 
 
 		 382 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.34 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  30.36 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  30.59 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  31.96 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.69 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  27.73 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  30.68 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  27.93 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  29.14 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  29.65 
 
 		 386 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  26.61 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  27.48 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 384 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  28.85 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  29.94 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.29 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  27.35 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  27.91 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.45 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  28.82 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.41 
 
 		 382 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  32.42 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  27.73 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  28.24 
 
 		 382 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  31.42 
 
 		 397 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  30.64 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  28.24 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  27.83 
 
 		 381 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  29.97 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  29.07 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  27.99 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  28.92 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  29.06 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.57 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  29.48 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  29.59 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  28.12 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  28.37 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  29.53 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  28.7 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  26.26 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  29.85 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  29.31 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  29.02 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  28.65 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  28.97 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  28.28 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  31.62 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  28.97 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.65 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  28.65 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  28.05 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  29.61 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 400 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  28.37 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  28.86 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  26.4 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  28.08 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  27.01 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  24.72 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  29.61 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  27.64 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  28.32 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  29.48 
 
 		 415 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  29.07 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  29.5 
 
 		 380 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  28.7 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  27.95 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  30.05 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  31.99 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>