217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0395 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 435 aa  884    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  56.84 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  43.78 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  39.43 
 
 		 457 aa  342  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  43.33 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  31.96 
 
 		 489 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  32.12 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  34.09 
 
 		 449 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  29.8 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 491 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 491 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 491 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  33.48 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.28 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  30.58 
 
 		 471 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  31.42 
 
 		 505 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  31.3 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.01 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  30.73 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  31.01 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.69 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  29.86 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  29.53 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  29.2 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  30.7 
 
 		 499 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  28.41 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  27.75 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  28.69 
 
 		 499 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0799  2-methylcitrate dehydratase  28.88 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  30.31 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1725  2-methylcitrate dehydratase  28.94 
 
 		 478 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  28.75 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  30.37 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  30.28 
 
 		 488 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  30.23 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  29.06 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  27.84 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  29.77 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  29.2 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  28.61 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  31.55 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2451  2-methylcitrate dehydratase  28.57 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0986896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  28.61 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  28.61 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  29.82 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  27.68 
 
 		 528 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  28.61 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  28.61 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  28.61 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  28.35 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  28.03 
 
 		 521 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  31.23 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  31.23 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  31.23 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1507  2-methylcitrate dehydratase  30.24 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  30.6 
 
 		 483 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  30.6 
 
 		 483 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2377  2-methylcitrate dehydratase  30.06 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  29.31 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  31.23 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1572  2-methylcitrate dehydratase  31.86 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  30.6 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  30.6 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  31.23 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  30.6 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  28 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  27.22 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  30.43 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  30.91 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  23.67 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2157  2-methylcitrate dehydratase  28.1 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  30.91 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  30.94 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  28.44 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  30.63 
 
 		 483 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1032  2-methylcitrate dehydratase  28.47 
 
 		 474 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1662  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1497  2-methylcitrate dehydratase  31.55 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  30.43 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  30.43 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  30.43 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1162  2-methylcitrate dehydratase  27.99 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.696099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2419  2-methylcitrate dehydratase  26.74 
 
 		 494 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00018845  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1486  2-methylcitrate dehydratase  31.23 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  29.25 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  29.22 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1302  2-methylcitrate dehydratase  30.49 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  30.63 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>