More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8534 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  100 
 
 
438 aa  865    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  56.39 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  49.33 
 
 
393 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.72 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.43 
 
 
388 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  56.03 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  47.78 
 
 
364 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.41 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  53.7 
 
 
374 aa  130  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  51.35 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.11 
 
 
321 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  46.32 
 
 
204 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.47 
 
 
329 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  49.12 
 
 
417 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  53.91 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.41 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
374 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.97 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
337 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  47.27 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  50 
 
 
392 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.74 
 
 
459 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
394 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
337 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45 
 
 
235 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  51.38 
 
 
446 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
453 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  41.32 
 
 
331 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  44.96 
 
 
388 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  38.61 
 
 
162 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.85 
 
 
366 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.86 
 
 
400 aa  106  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  51.49 
 
 
281 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.15 
 
 
340 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  46.08 
 
 
368 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  50.53 
 
 
333 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
350 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  52.69 
 
 
293 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  50.49 
 
 
535 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.09 
 
 
176 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  50 
 
 
367 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
501 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
306 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  49.06 
 
 
326 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
180 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  40 
 
 
517 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  46 
 
 
347 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  46.77 
 
 
308 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  44.76 
 
 
347 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
348 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.96 
 
 
373 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
524 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  38.97 
 
 
505 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  38.05 
 
 
348 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
348 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.14 
 
 
330 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
363 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  46.23 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  37.25 
 
 
432 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.33 
 
 
491 aa  97.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  42.72 
 
 
361 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
361 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.08 
 
 
368 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  47.71 
 
 
327 aa  96.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
363 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  42.45 
 
 
372 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
372 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.82 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  48.45 
 
 
333 aa  95.5  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49 
 
 
556 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  48 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
349 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  43.36 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.64 
 
 
337 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
173 aa  94.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
372 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
335 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 
378 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  32.89 
 
 
273 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.71 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
360 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
348 aa  91.3  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  47.22 
 
 
432 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  48.45 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
469 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>