More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8110 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  100 
 
 
387 aa  766    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  80.1 
 
 
384 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  72.28 
 
 
388 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  68.73 
 
 
418 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  68.48 
 
 
390 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  69.71 
 
 
390 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  66.58 
 
 
399 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  64.18 
 
 
398 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  67.28 
 
 
391 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  64.68 
 
 
416 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  65.36 
 
 
391 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  68.05 
 
 
419 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  64.69 
 
 
401 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  63.9 
 
 
387 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  61.66 
 
 
422 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  61.04 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  61.08 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  65.89 
 
 
424 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  61.92 
 
 
397 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  61.99 
 
 
412 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  65.36 
 
 
391 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  60.31 
 
 
407 aa  431  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  62.31 
 
 
400 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  62.72 
 
 
401 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  60.31 
 
 
397 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  60.31 
 
 
397 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  60.31 
 
 
397 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  59.14 
 
 
412 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  58.87 
 
 
413 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  60.53 
 
 
393 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  61.24 
 
 
408 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  58.76 
 
 
401 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.58 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.42 
 
 
399 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.6 
 
 
384 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.13 
 
 
392 aa  328  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.48 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.08 
 
 
384 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  45 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.17 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 
394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.03 
 
 
390 aa  319  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.05 
 
 
392 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.94 
 
 
400 aa  318  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.42 
 
 
398 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.74 
 
 
398 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.88 
 
 
396 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.3 
 
 
404 aa  316  5e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 
402 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.59 
 
 
396 aa  315  7e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.26 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.86 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.5 
 
 
398 aa  311  9e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.48 
 
 
393 aa  311  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.93 
 
 
393 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.17 
 
 
382 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  51.17 
 
 
400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.22 
 
 
409 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.19 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.82 
 
 
396 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.85 
 
 
379 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.39 
 
 
404 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  52.41 
 
 
407 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.05 
 
 
401 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  47.68 
 
 
385 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  43.19 
 
 
393 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.41 
 
 
395 aa  292  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.73 
 
 
398 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.73 
 
 
398 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.99 
 
 
398 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.98 
 
 
394 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.56 
 
 
389 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  44.39 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.51 
 
 
407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  48.09 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  40.73 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.58 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  40.89 
 
 
398 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  40.99 
 
 
383 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.33 
 
 
401 aa  279  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  41.24 
 
 
381 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.26 
 
 
388 aa  276  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  47.85 
 
 
388 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.24 
 
 
381 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  45.03 
 
 
385 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  40.97 
 
 
381 aa  275  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.51 
 
 
396 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.53 
 
 
381 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.78 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.56 
 
 
394 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.04 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40.97 
 
 
381 aa  272  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.97 
 
 
381 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40.97 
 
 
381 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40.97 
 
 
381 aa  272  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.21 
 
 
401 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  40.58 
 
 
397 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.08 
 
 
389 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>