More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7358 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 		 560 aa  842    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 549 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 559 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  61.15 
 
 		 559 aa  703    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.33 
 
 		 551 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.9 
 
 		 555 aa  685    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.52 
 
 		 549 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.19 
 
 		 558 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 		 549 aa  671    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.97 
 
 		 551 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 559 aa  780    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.64 
 
 		 560 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  86.82 
 
 		 554 aa  986    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.84 
 
 		 557 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  74.51 
 
 		 557 aa  839    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  61.96 
 
 		 551 aa  662    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  75.94 
 
 		 556 aa  864    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  77.18 
 
 		 560 aa  868    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 		 555 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 563 aa  635    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.07 
 
 		 547 aa  899    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 		 549 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 		 558 aa  865    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 		 549 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.14 
 
 		 550 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 563 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.34 
 
 		 554 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.79 
 
 		 557 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 554 aa  1137    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 		 551 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 561 aa  661    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  67.86 
 
 		 558 aa  771    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.81 
 
 		 559 aa  764    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 		 550 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 		 560 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.48 
 
 		 556 aa  653    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.09 
 
 		 557 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.62 
 
 		 559 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 		 555 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 561 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 556 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 		 551 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.35 
 
 		 559 aa  836    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 559 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 555 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 561 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.44 
 
 		 560 aa  836    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 		 549 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 559 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  75.4 
 
 		 560 aa  858    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  62 
 
 		 584 aa  669    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 		 554 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 		 549 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.56 
 
 		 559 aa  761    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 555 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.37 
 
 		 560 aa  821    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 549 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.09 
 
 		 558 aa  866    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.33 
 
 		 550 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 558 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 		 560 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 550 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.97 
 
 		 555 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 670 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 549 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 		 551 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.84 
 
 		 557 aa  837    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.5 
 
 		 559 aa  762    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.52 
 
 		 549 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 		 556 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 551 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.03 
 
 		 558 aa  900    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 		 561 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 549 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 		 560 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.62 
 
 		 560 aa  839    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 		 555 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.91 
 
 		 558 aa  868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 555 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.22 
 
 		 560 aa  846    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.73 
 
 		 554 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 		 560 aa  854    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.09 
 
 		 558 aa  853    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.18 
 
 		 560 aa  869    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 561 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 560 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.49 
 
 		 558 aa  895    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.92 
 
 		 556 aa  875    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 		 559 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.81 
 
 		 558 aa  773    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 		 551 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.11 
 
 		 560 aa  847    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.84 
 
 		 557 aa  837    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 		 549 aa  658    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.22 
 
 		 557 aa  847    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 561 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.3 
 
 		 560 aa  807    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 559 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 549 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>