More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5343 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5343  cytochrome P-450  100 
 
 
385 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6336  Cytochrome P450-like protein  59.48 
 
 
381 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.62 
 
 
400 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  30.85 
 
 
391 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2327  cytochrome P450-like protein  30.64 
 
 
408 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.283522  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  32.08 
 
 
416 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.02 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  31.38 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  31.96 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.66 
 
 
412 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.03 
 
 
411 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.99 
 
 
405 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  30.77 
 
 
407 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  32.92 
 
 
393 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  29.51 
 
 
382 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  32.31 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  28.06 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  29.62 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  30.12 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  31.28 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  30.94 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  29.68 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  30.73 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  28.57 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  30.39 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  29.25 
 
 
399 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  31.59 
 
 
418 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  31.63 
 
 
400 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  29.22 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  30.61 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  31.37 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  30.15 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  27.86 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  31.97 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  30.5 
 
 
398 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  29.14 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  28.08 
 
 
403 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.04 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  27.56 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  30.85 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  28.93 
 
 
409 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  31.33 
 
 
410 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  29.85 
 
 
408 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  27.7 
 
 
409 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  29.65 
 
 
402 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  27.51 
 
 
376 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  27.75 
 
 
420 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  28.43 
 
 
424 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  27.89 
 
 
395 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  31.19 
 
 
406 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  31.19 
 
 
406 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  31.19 
 
 
406 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  31.78 
 
 
401 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  29.34 
 
 
402 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  28.65 
 
 
399 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3776  cytochrome P450  30.43 
 
 
413 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  28.96 
 
 
414 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.11 
 
 
411 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  30.42 
 
 
395 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  28.49 
 
 
400 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  30.68 
 
 
395 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  29.04 
 
 
397 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  29.4 
 
 
399 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  28.76 
 
 
407 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  28.76 
 
 
407 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  33.74 
 
 
430 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  27.3 
 
 
388 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  32.28 
 
 
389 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  32.17 
 
 
357 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  28.81 
 
 
397 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  27.42 
 
 
401 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  28.11 
 
 
409 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  28.42 
 
 
421 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  32.55 
 
 
400 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  29.73 
 
 
421 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  30.45 
 
 
400 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  31.99 
 
 
406 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  29.07 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  28.76 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  28.12 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  28.76 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  32.24 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  29.07 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  26.49 
 
 
419 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  28.57 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  28.73 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  29.34 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  29.17 
 
 
409 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  24.38 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  29.63 
 
 
404 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  28.75 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  27.86 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.28 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  28.91 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  26.78 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  30.73 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  31.67 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  28.37 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  29.08 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0363  cytochrome P450  28.15 
 
 
409 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>