More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5238 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  47.87 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  47.89 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  45.5 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.6 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  37.19 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.44 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  38.86 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  36.41 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  39.5 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  34.6 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  34.48 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  28.5 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  29.63 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  33.02 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.53 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  35.05 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  23.83 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  31.9 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  30.85 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.04 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  32.11 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  26.26 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  26.67 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  26.82 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  31.46 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  28.11 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  26.37 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  26.37 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  26.37 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  25.58 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  36.16 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  24.41 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.79 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.84 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  27.65 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  33.74 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  26.67 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  28.44 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25.58 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.78 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  24.39 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  33.65 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  25.24 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  28.31 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  28.17 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.85 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.44 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  28 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  33.18 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  28.11 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  27.23 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  37.04 
 
 		 854 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  27.62 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  29.91 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  32.2 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  29.91 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  29.86 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  25.63 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  25.91 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>