More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5044 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5044  amidase  100 
 
 		 473 aa  940    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00761067  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6180  amidase  56.41 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  47.29 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  47.72 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  47.29 
 
 		 490 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0575  Amidase  45.47 
 
 		 477 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0165  amidase  38.89 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.54 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 		 485 aa  196  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.46 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.71 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  34.59 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.46 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  32.97 
 
 		 474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  33.81 
 
 		 471 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3796  putative amidase  34.84 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.86 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  35.46 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  34.59 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  33.97 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  34.95 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.06 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  34.76 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.02 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  33.47 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.6 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.35 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  34.28 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.69 
 
 		 485 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  33.61 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  34.39 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  34.47 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  34.92 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  34.48 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.95 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  31.96 
 
 		 494 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.21 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.98 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 482 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.25 
 
 		 463 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.35 
 
 		 494 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.24 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  32.85 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  32.35 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.4 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  25.87 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.69 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  30.87 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  33.26 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  33.26 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  32.7 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1643  amidase  34.53 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0396025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  33.77 
 
 		 535 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  32.91 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  33.61 
 
 		 507 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  33.41 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  31.63 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  34.04 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.19 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.76 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  32.97 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  34.25 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  30.79 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.9 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.78 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  33.05 
 
 		 473 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  33.96 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  33.05 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  31.79 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  33.05 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  33.33 
 
 		 490 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.3 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  33.12 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.3 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  32.21 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  31.1 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  32.55 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  31.1 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  31.1 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  33.33 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  34.01 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  35.78 
 
 		 504 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  35.01 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  33.47 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  33.12 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  30.94 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  30.39 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.7 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.4 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.29 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  31.24 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.57 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  32.37 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.66 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  32.85 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  30.62 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  32.9 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>