More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6180 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6180  amidase  100 
 
 		 470 aa  945    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5044  amidase  56.41 
 
 		 473 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00761067  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  50.54 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  50.54 
 
 		 490 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  50.54 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0575  Amidase  50.87 
 
 		 477 aa  358  8e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0165  amidase  41.45 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3796  putative amidase  37.13 
 
 		 500 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  34.78 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.79 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  35.46 
 
 		 475 aa  222  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  37.89 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.43 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.58 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  37.9 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  36.5 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  34.33 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  37.25 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  30.98 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  36.38 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.04 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.22 
 
 		 499 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.47 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  37.34 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.64 
 
 		 486 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  36.15 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.94 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.49 
 
 		 486 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  34.51 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  33.78 
 
 		 477 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  34.68 
 
 		 467 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.81 
 
 		 463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  33.55 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  35.96 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.61 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  34.64 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.19 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  35.82 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  33.12 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.84 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.26 
 
 		 494 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  32.91 
 
 		 469 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  34.69 
 
 		 468 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.04 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  31.77 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  37.08 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  34.99 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  34.05 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.05 
 
 		 494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.72 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  35.03 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  34.27 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  33.99 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.33 
 
 		 470 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  31.48 
 
 		 480 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  33.54 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.84 
 
 		 494 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  33.61 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.06 
 
 		 488 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.04 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  34.31 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.36 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  33.7 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.36 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.36 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  33.26 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  33.26 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  25.66 
 
 		 486 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  33.53 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  34.3 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  33.75 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  31.78 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.46 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  40.07 
 
 		 469 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.56 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.99 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  32.48 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  33.19 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  33.47 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.66 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  29.53 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.25 
 
 		 496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.82 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  32.77 
 
 		 516 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  32.63 
 
 		 475 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  31.99 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  30.36 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2248  amidase  32.77 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  33.26 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  33.4 
 
 		 492 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  32.5 
 
 		 484 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  31.18 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.04 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.06 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  31.19 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  32.85 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1118  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.6 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00327681  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.01 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.46 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4324  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000269124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>