88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4308 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  29.27 
 
 		 381 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  27.65 
 
 		 377 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  34.67 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.08 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.51 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  25.14 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.89 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 393 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 375 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.66 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 376 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0583  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000328472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  21.25 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.2 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0524  hypothetical protein  24.9 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000443046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 367 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.8 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 384 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  32.58 
 
 		 371 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  30.72 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.33 
 
 		 378 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.33 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 384 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1602  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.863835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.36 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 366 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  28.25 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  25.74 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  32.22 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  31.35 
 
 		 379 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  29.9 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.81 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.47 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  22.04 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 370 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 375 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 401 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 398 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  25.17 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.63 
 
 		 376 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  25.14 
 
 		 264 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 363 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 278 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  37.65 
 
 		 379 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 374 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 253 aa  42  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 253 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>