45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0583 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0583  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 246 aa  464  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000328472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.33 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.21 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.85 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  32.89 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.66 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.31 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.14 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  34 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.09 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 344 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.21 
 
 		 373 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 		 247 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 290 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 358 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.64 
 
 		 261 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>