294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3127 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  69.59 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08160  LysR family regulator  59.07 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1818  transcriptional regulator, LysR family  56.52 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2045  LysR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.416404  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1918  transcriptional regulator, LysR family  53.66 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4302  LysR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1801  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1867  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.749679  normal  0.902128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1820  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.822688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1897  transcriptional regulator, LysR family  44.74 
 
 		 269 aa  181  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.843455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0048  transcriptional regulator, LysR family  42.51 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2644  transcriptional regulator, LysR family  51.38 
 
 		 306 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0059  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2610  LysR, substrate-binding  46.39 
 
 		 197 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0541  transcriptional regulator, LysR family  42.98 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13200  LysR family regulator  33.33 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  26.29 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  62  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0337  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0334498  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1674  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3286  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254644  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2452  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.57 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.57 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  25.14 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.57 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  25.14 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.57 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  25.14 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.57 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2230  LysR substrate-binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.14 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 301 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.14 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  25.14 
 
 		 301 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 321 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.76 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 317 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  25.14 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 306 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4763  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3228  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1196  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188455  normal  0.473378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>