More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1820 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1867  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.749679  normal  0.902128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1820  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.822688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1801  LysR family transcriptional regulator  98.73 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2045  LysR family transcriptional regulator  84.39 
 
 		 237 aa  361  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.416404  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4302  LysR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 229 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1818  transcriptional regulator, LysR family  65.85 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  50.43 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  48.95 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1897  transcriptional regulator, LysR family  45.98 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.843455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1918  transcriptional regulator, LysR family  47.52 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08160  LysR family regulator  48.88 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2610  LysR, substrate-binding  44.04 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2644  transcriptional regulator, LysR family  47.49 
 
 		 306 aa  148  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0048  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0541  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0059  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13200  LysR family regulator  36.04 
 
 		 181 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 289 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 299 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  28.5 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.5 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  28.5 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.5 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.5 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.5 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.5 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  36.17 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  25.74 
 
 		 301 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 301 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 301 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  25.74 
 
 		 301 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  25.74 
 
 		 301 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  25.98 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  25.98 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1102  LysR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  30.68 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  30.23 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.04 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  26.4 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  31.52 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4580  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.308792  normal  0.669632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  31.02 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  31.02 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  31.02 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  20.99 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1712  transcriptional regulator, LysR family  24.59 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 317 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 311 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  26.75 
 
 		 321 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 322 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>