287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1918 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1918  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 247 aa  467  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  50.41 
 
 		 242 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  52.79 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1897  transcriptional regulator, LysR family  46.03 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.843455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1818  transcriptional regulator, LysR family  51.98 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2045  LysR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.416404  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08160  LysR family regulator  46.9 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4302  LysR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0541  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1801  LysR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1867  LysR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.749679  normal  0.902128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1820  LysR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.822688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2610  LysR, substrate-binding  44.33 
 
 		 197 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0048  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2644  transcriptional regulator, LysR family  47.89 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0059  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13200  LysR family regulator  40.21 
 
 		 181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 289 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  25.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  25.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  25.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.67 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  25.67 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  25.67 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.67 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  30.06 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2452  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00910  hypothetical protein  28.1 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  32.43 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0884  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000164987  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0921  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 296 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 295 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3051  LysR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000517942  normal  0.0334887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4355  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 301 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  33.33 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  33.33 
 
 		 306 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  33.33 
 
 		 306 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  33.33 
 
 		 306 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 303 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  33.33 
 
 		 306 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  33.33 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 299 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7661  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5363  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.782809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  32.69 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  33.33 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1422  transcriptional regulator, LysR family  26.88 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 300 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  19.28 
 
 		 300 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1046  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  26.53 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2085  transcriptional regulator, LysR family  20.32 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.37 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>