More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4302 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4302  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2045  LysR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 237 aa  314  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.416404  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1801  LysR family transcriptional regulator  76.86 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1820  LysR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.822688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1867  LysR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.749679  normal  0.902128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1818  transcriptional regulator, LysR family  62.93 
 
 		 246 aa  264  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  50.44 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  49.12 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08160  LysR family regulator  55.15 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1897  transcriptional regulator, LysR family  47.94 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.843455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1918  transcriptional regulator, LysR family  47.18 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2610  LysR, substrate-binding  42.42 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2644  transcriptional regulator, LysR family  46.45 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0541  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0048  transcriptional regulator, LysR family  39.41 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0059  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13200  LysR family regulator  35.42 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 289 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  30.17 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2452  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  24.88 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  23.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  23.65 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  23.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  23.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  23.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  23.65 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  23.65 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  24.38 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  24.38 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  24.38 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  24.38 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  24.38 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  24.38 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  24.38 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  29.53 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  29.53 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  29.53 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  29.53 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  28.26 
 
 		 321 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2230  LysR substrate-binding protein  30.97 
 
 		 313 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4763  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.19 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 331 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.49 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 323 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3491  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 290 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 299 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 320 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 300 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 311 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  22.54 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>