26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13200  LysR family regulator  100 
 
 		 181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2610  LysR, substrate-binding  41.8 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1918  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 247 aa  131  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1897  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 269 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.843455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1818  transcriptional regulator, LysR family  38.07 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0048  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2045  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.416404  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4302  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 241 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1867  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.749679  normal  0.902128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1820  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.822688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0059  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1801  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 237 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.557057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08160  LysR family regulator  34.87 
 
 		 276 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2644  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0541  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00910  hypothetical protein  28.95 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 299 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 298 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 316 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 303 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7661  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 304 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 309 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>