More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2550 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 		 489 aa  958    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  41.23 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5304  beta-lactamase  34.39 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  40.48 
 
 		 377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  35.88 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  33.24 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  30.35 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2704  beta-lactamase  30.03 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  35.56 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  29.73 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  27.08 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  29.72 
 
 		 404 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.42 
 
 		 595 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  31.77 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  27.88 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.29 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.29 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  27.27 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  24.51 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  27.67 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.99 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.24 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  20.91 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  20.92 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  20.92 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  20.92 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.58 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30.47 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  20.97 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  25.07 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.08 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  27.78 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.84 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  26.5 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.03 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.95 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.62 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  25.94 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  29.13 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  22.81 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  21.84 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  25.66 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.06 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.97 
 
 		 720 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  25.35 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1624  beta-lactamase  26.3 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000378286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  22.81 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  29.29 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  29.32 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.93 
 
 		 601 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  21.59 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  25.53 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.65 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.6 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.95 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25.98 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.52 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  25.53 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.97 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  21.76 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.53 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.99 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.49 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.3 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  26.9 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.63 
 
 		 392 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.39 
 
 		 378 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.03 
 
 		 513 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.22 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.45 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  28.31 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  23.77 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  28.22 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.19 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.47 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.12 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.29 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.34 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  26.33 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  24.92 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.94 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  23.65 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  27.86 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  23.53 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.12 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.2 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.14 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.61 
 
 		 681 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  24.18 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  22.39 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  24.94 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  23.67 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  24.38 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.45 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  24.52 
 
 		 364 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  29.55 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.68 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.72 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  23.32 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>