More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0618 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  67.3 
 
 
264 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  67.3 
 
 
272 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  62.74 
 
 
267 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  63.12 
 
 
263 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  63.88 
 
 
268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  64.26 
 
 
288 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  62.21 
 
 
268 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  58.94 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  58.56 
 
 
267 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  54.96 
 
 
266 aa  321  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  58.56 
 
 
276 aa  321  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  56.27 
 
 
274 aa  315  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  55.89 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 
266 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 
266 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 
266 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  55.89 
 
 
267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  53.03 
 
 
270 aa  305  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  52.65 
 
 
273 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  50.76 
 
 
273 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  46.95 
 
 
269 aa  281  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 
268 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  48.97 
 
 
245 aa  265  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  48.46 
 
 
281 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 
270 aa  224  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 
268 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.54 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.38 
 
 
273 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.69 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  25.95 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
269 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.75 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  26.91 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.8 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.69 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  21.56 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.26 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  24.42 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  21.19 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  22.22 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  22.84 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  24.6 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.36 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  24.3 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  24.3 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>