More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1697 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  90.99 
 
 		 366 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  91.27 
 
 		 366 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  91.27 
 
 		 366 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  90.91 
 
 		 360 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  90.91 
 
 		 360 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  90.91 
 
 		 360 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  90.91 
 
 		 360 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  88.83 
 
 		 361 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  80.11 
 
 		 369 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  82.42 
 
 		 366 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  80.4 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  81.59 
 
 		 366 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  77.62 
 
 		 372 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  76.94 
 
 		 360 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  77.27 
 
 		 360 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  53.48 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  52.69 
 
 		 361 aa  361  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  55.28 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  51.42 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  49.86 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  49.86 
 
 		 362 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  49.86 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  49.86 
 
 		 362 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  54.24 
 
 		 355 aa  355  5.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  49.86 
 
 		 362 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  54.19 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  49.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  49.86 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  49.86 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  49.86 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  50.41 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  51.27 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  50.97 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  49.58 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  49.31 
 
 		 357 aa  322  8e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  43.97 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  46.94 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  46.93 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  44.99 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.32 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  46.94 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  44.67 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  45.94 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  48.75 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  47.74 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  45.92 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  41.88 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  48.75 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  46.96 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  43.02 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  45.86 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  46.13 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  43.47 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  46.41 
 
 		 356 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  46.41 
 
 		 356 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  45.86 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  43.8 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  46.13 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  40.11 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  43.47 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  43.47 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  37.08 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.67 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.54 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0858  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.640782  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.51 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.51 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.51 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.51 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.51 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.1 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.1 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.09 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.96 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.96 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  31.13 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  28.62 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.17 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25 
 
 		 369 aa  105  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.3 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.29 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.04 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  27.94 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>