285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3932 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  79.34 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  78.6 
 
 
281 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  52.42 
 
 
295 aa  301  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  49.65 
 
 
304 aa  291  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  49.1 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  46.02 
 
 
310 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  46.59 
 
 
306 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  47.84 
 
 
303 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  45.94 
 
 
304 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  46.04 
 
 
302 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  45.58 
 
 
304 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  47.84 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  46.07 
 
 
302 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  46.15 
 
 
308 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  46.5 
 
 
308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  45.77 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.64 
 
 
310 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  44.09 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.66 
 
 
300 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  46.04 
 
 
304 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  43.79 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  42.23 
 
 
327 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  41.96 
 
 
322 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  42.47 
 
 
313 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  43.51 
 
 
332 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  42.81 
 
 
325 aa  225  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  41.24 
 
 
353 aa  224  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  40.42 
 
 
312 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  42.51 
 
 
313 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  42.51 
 
 
313 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  41.69 
 
 
312 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  42.51 
 
 
316 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  42.51 
 
 
313 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  42.51 
 
 
313 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  42.5 
 
 
307 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  41.79 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  40.77 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  42.65 
 
 
304 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  43.36 
 
 
316 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  41.49 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  39.29 
 
 
362 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  44.36 
 
 
287 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  44 
 
 
281 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  39.49 
 
 
328 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  40.43 
 
 
338 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  39.18 
 
 
357 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  39.04 
 
 
350 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.35 
 
 
323 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  39.73 
 
 
324 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  37.84 
 
 
352 aa  201  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  37.68 
 
 
328 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  36.75 
 
 
338 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  41.3 
 
 
314 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  39.29 
 
 
363 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.77 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  39.27 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  36.73 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  38.31 
 
 
372 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  39.12 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  40.24 
 
 
247 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  36.45 
 
 
342 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  36.05 
 
 
371 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  37.5 
 
 
339 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.07 
 
 
407 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.64 
 
 
545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  37.71 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  35.76 
 
 
334 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  36.27 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.76 
 
 
406 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  34.38 
 
 
343 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.08 
 
 
415 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.1 
 
 
533 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  32.2 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  40.11 
 
 
183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  40.11 
 
 
183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  30.98 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  32.91 
 
 
353 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.04 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.96 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.64 
 
 
307 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.27 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  24.78 
 
 
398 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  45.92 
 
 
131 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  45.92 
 
 
131 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  29.12 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.43 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.84 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.84 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.19 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.19 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.09 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.45 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.71 
 
 
581 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.12 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.6 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.97 
 
 
579 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.97 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.97 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.53 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>