173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3146 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  56.12 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  56.63 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  52.26 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  54.08 
 
 		 197 aa  218  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  54.08 
 
 		 197 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  53.57 
 
 		 197 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  53.57 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  47.89 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  48.15 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  48.4 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  48.97 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  44.44 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  45.74 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  47.59 
 
 		 198 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  47.67 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  44.33 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  46.28 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  43.3 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  50.53 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  44.79 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  45.03 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  50.26 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  51.06 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  41.58 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  40.62 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  41.4 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  40.86 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  41.94 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  40.31 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  38.54 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  37.31 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  45.71 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  41.53 
 
 		 190 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  44.86 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  36.87 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  38.12 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  40.11 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  35.57 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  38.02 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  37.5 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  37.85 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  34.85 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  36.65 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  36.46 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  35.23 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  36.25 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  40.34 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  34.09 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  34.09 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  34.09 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  34.66 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  34.09 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  34.66 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  32.99 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  32.99 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  32.28 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  33.16 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  32.49 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  32.28 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  31.66 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  34.64 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  30.21 
 
 		 315 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  32.52 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  35.91 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  30.77 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.38 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  34.53 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  32.95 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  34.59 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  30.46 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  31.01 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.67 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.08 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.45 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  27.43 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  32.48 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.95 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.25 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.47 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.7 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  27.27 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  27.5 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.52 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.04 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.88 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  27.63 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.27 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.02 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  26.96 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>