213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3550 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.51 
 
 
293 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  77.85 
 
 
293 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  77.51 
 
 
293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  77.93 
 
 
297 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  77.16 
 
 
293 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  80.28 
 
 
292 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  72.57 
 
 
294 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  75.78 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  73.36 
 
 
294 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  68.97 
 
 
293 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  68.77 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  74.05 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  72.92 
 
 
294 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  55.28 
 
 
298 aa  305  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  49.48 
 
 
288 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  49.3 
 
 
291 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  75.36 
 
 
145 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  39.93 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  30 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.62 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.93 
 
 
297 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  27.93 
 
 
297 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  28.94 
 
 
309 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  27.49 
 
 
287 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
317 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 
315 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
289 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  26.1 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
293 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  29.2 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  28.83 
 
 
320 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  27.09 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  28.1 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.08 
 
 
287 aa  87  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  26.51 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  24.83 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  26.19 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  26.19 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.86 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  25.86 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.48 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.1 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.75 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.09 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.47 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  25.5 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.29 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.93 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.15 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  28.29 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.41 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.12 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.12 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.7 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.71 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  28.38 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.51 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  24.24 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.76 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  22.79 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.14 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.89 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  28.9 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  24.9 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  28.09 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  28.09 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  28.09 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  24.54 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.25 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.59 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  24.75 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.99 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.68 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  25.35 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  25.81 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  28.03 
 
 
300 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  24.92 
 
 
298 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.58 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.64 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  25.67 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.36 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  22.97 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  24.91 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  22.73 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.6 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.46 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.55 
 
 
274 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>