284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5061 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 
715 aa  1420    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  54.55 
 
 
540 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  45.21 
 
 
540 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  45.02 
 
 
540 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  45.03 
 
 
515 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  45 
 
 
511 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  45.55 
 
 
528 aa  353  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  41.62 
 
 
517 aa  350  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
532 aa  350  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
532 aa  350  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  43.1 
 
 
531 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  43.38 
 
 
516 aa  346  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  42.07 
 
 
528 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  43.34 
 
 
520 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  40.11 
 
 
520 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  42.24 
 
 
520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  40.38 
 
 
519 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  41.5 
 
 
521 aa  336  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  40.47 
 
 
520 aa  336  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  41.22 
 
 
521 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  41.21 
 
 
531 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  42.07 
 
 
531 aa  334  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  38.27 
 
 
506 aa  333  5e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  40.84 
 
 
511 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  40.54 
 
 
518 aa  329  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  41.71 
 
 
521 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  40.34 
 
 
524 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  40.15 
 
 
524 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  40.15 
 
 
524 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  40.15 
 
 
524 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  41.53 
 
 
524 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  39.88 
 
 
535 aa  316  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  36.63 
 
 
508 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  39.41 
 
 
533 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  38.51 
 
 
509 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  39.96 
 
 
514 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  35.17 
 
 
507 aa  300  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  34.04 
 
 
516 aa  296  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  38.45 
 
 
511 aa  293  6e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  37.97 
 
 
511 aa  291  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  38.42 
 
 
520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 
508 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  34.97 
 
 
567 aa  286  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.91 
 
 
514 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.96 
 
 
507 aa  285  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.98 
 
 
504 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  38.58 
 
 
513 aa  283  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  38.37 
 
 
506 aa  283  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  39.03 
 
 
509 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.98 
 
 
504 aa  282  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  39.05 
 
 
504 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  36.97 
 
 
498 aa  280  8e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  40.56 
 
 
512 aa  280  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  40.77 
 
 
512 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  37.02 
 
 
507 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  37.69 
 
 
515 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  35.6 
 
 
511 aa  278  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  41.81 
 
 
526 aa  277  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  36.13 
 
 
513 aa  277  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 
509 aa  277  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  37.61 
 
 
507 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  38.73 
 
 
515 aa  274  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  36.52 
 
 
507 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 
507 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 
507 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  34.45 
 
 
505 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  34.47 
 
 
505 aa  272  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  38.82 
 
 
523 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  37.01 
 
 
528 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  36.29 
 
 
507 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  36.09 
 
 
515 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  34.89 
 
 
505 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  35.71 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  34.89 
 
 
505 aa  271  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  34.75 
 
 
505 aa  271  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
507 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  38.82 
 
 
523 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  37.72 
 
 
506 aa  271  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  36.87 
 
 
526 aa  271  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 
517 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4004  histidine ammonia-lyase  35.77 
 
 
537 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187247  normal  0.249864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  34.75 
 
 
505 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  34.45 
 
 
506 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  34.54 
 
 
505 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  34.54 
 
 
505 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  35.74 
 
 
502 aa  270  8.999999999999999e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  36.69 
 
 
514 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  39.27 
 
 
507 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  38.83 
 
 
499 aa  269  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  36.31 
 
 
509 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  34.24 
 
 
505 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  39.35 
 
 
518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  34.52 
 
 
510 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  34.99 
 
 
513 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  33.97 
 
 
510 aa  267  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  39.06 
 
 
507 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  34.58 
 
 
513 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  39.06 
 
 
533 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>