227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4427 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 310 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  66.04 
 
 		 359 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.36 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  63.52 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.51 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.39 
 
 		 289 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.69 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.18 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  57.2 
 
 		 309 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.47 
 
 		 283 aa  291  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.64 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  57.3 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.69 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  58.91 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  58.91 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  58.91 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  58.6 
 
 		 342 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.05 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.23 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.4 
 
 		 354 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  57.43 
 
 		 296 aa  271  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.89 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.92 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.68 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.6 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.36 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  52.33 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  53.96 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.29 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  54.41 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.02 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  46.74 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.67 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  37.32 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.29 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  30.98 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  32.37 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.79 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.85 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.85 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.11 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.75 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.3 
 
 		 242 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.91 
 
 		 245 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  28.95 
 
 		 262 aa  92.8  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.39 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.51 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  28.51 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.67 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  30.99 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  30.58 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.54 
 
 		 284 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.93 
 
 		 261 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.34 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  26 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.97 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.82 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  29.8 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.12 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.82 
 
 		 243 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.62 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  31.18 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  31.4 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  28.52 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  29.62 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  31.96 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.34 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  30.5 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.42 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.58 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.83 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  32.08 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  28.99 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  29.17 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  27.64 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.47 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  30.04 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  31.67 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.33 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  26.8 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  29.63 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  30.89 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>