More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2850 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2850  ABC transporter related protein  100 
 
 		 250 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71791  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3321  ABC transporter related  52.79 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0669  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  45.66 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  47.32 
 
 		 484 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  42.47 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.15 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  43.87 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.23 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.98 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.25 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  45.91 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  42.73 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  47.47 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  40.76 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.12 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  42.13 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  44.39 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  42.15 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  44.39 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.83 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.34 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.95 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  43.26 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.96 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 233 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 233 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  42.67 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  44.25 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  42.38 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  41.99 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.96 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  42.37 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  40.81 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.34 
 
 		 233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.2 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  40.51 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  43.58 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.19 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.78 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  41.86 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  42.33 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  40.76 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  40.09 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  40.09 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.78 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  45.41 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  40.09 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  41.48 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  44.81 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  42.59 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  43.05 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  39.74 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2946  ABC transporter related  43.98 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.02 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  39.46 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.08 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  44.6 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  41.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  42.66 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  39.56 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3082  ABC transporter related  45.95 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.0615819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  43.4 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  42.2 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  42.11 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  39.56 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  43.1 
 
 		 505 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  40.61 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  41.4 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  38.6 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  43.67 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>