63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0945 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 495 aa  950    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  44.85 
 
 		 434 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  42.28 
 
 		 536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  44.5 
 
 		 582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  31.62 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  32.97 
 
 		 523 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 499 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.36 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  18.93 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 494 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  29.17 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 489 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  19.33 
 
 		 423 aa  53.9  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 447 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 476 aa  51.2  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  20.92 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  24.62 
 
 		 499 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 135 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 516 aa  50.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  21.86 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  27.85 
 
 		 467 aa  47  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  28.76 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  21.14 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  21.44 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  26.34 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 456 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  27.12 
 
 		 496 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>