65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0577 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  33.14 
 
 
192 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  36.05 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  36.54 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  31.79 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  35.14 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  34.29 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  33.8 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  33.8 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  32.86 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  33.8 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  40 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  38 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  34.65 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  31.22 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  35.35 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  37.14 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  35 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  35.71 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  31.65 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  30.19 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  35.2 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  34.15 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  30.08 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  26.01 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  34.69 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  39.6 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  26.74 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  32.95 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  33 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  32.33 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  31.9 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  26.9 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  29.38 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  32.48 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31 
 
 
192 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  28.21 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  28.36 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  28.72 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  29.1 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  29.35 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  25.84 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  33 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  27.42 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  29.66 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  34.52 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8439  protein of unknown function DUF1470  45.65 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  31.33 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  25.99 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4291  protein of unknown function DUF1470  43.86 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  32.94 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3059  hypothetical protein  30.93 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000109347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  30.93 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3363  hypothetical protein  29.9 
 
 
180 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  42.86 
 
 
184 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  29.9 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  37.5 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  32.94 
 
 
219 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  32.94 
 
 
219 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>