More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1103 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  49.55 
 
 		 885 aa  775    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  100 
 
 		 861 aa  1710    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 943 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 878 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  33.3 
 
 		 911 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  33.85 
 
 		 903 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  33.3 
 
 		 903 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  33.84 
 
 		 903 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 944 aa  469  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  36.57 
 
 		 926 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 875 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 888 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 928 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  34.9 
 
 		 902 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  34.59 
 
 		 945 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 894 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  34.79 
 
 		 902 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  32.67 
 
 		 885 aa  464  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 876 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 868 aa  462  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  35.63 
 
 		 877 aa  462  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  34.88 
 
 		 877 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 906 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 891 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  33.15 
 
 		 907 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  33.26 
 
 		 939 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 893 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 892 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  33.41 
 
 		 892 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 950 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.74 
 
 		 891 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.39 
 
 		 876 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 891 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  35.39 
 
 		 891 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 877 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 877 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 877 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 870 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 918 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 877 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 896 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 877 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  34.28 
 
 		 931 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  35.65 
 
 		 872 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 877 aa  452  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 903 aa  451  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  32.48 
 
 		 922 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 879 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 892 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 862 aa  448  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  33.15 
 
 		 903 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 928 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 880 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  31.74 
 
 		 917 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 888 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  33.23 
 
 		 933 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  33.3 
 
 		 885 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 926 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 877 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  35.44 
 
 		 936 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 896 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 879 aa  446  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  32.87 
 
 		 922 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 855 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  32.62 
 
 		 922 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  33.51 
 
 		 916 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 928 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 928 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  32.85 
 
 		 878 aa  442  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  32.07 
 
 		 917 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  35.53 
 
 		 902 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 873 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  32.94 
 
 		 930 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  32.07 
 
 		 917 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 928 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 928 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  32.17 
 
 		 917 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  33.63 
 
 		 893 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 875 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 892 aa  439  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 892 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  32.51 
 
 		 925 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 896 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 885 aa  438  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  35.36 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 846 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  33.62 
 
 		 910 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 917 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 917 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 917 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  32.52 
 
 		 888 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  34.17 
 
 		 896 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  32.65 
 
 		 906 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 935 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  32.81 
 
 		 913 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  35.25 
 
 		 866 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  32.33 
 
 		 945 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>