More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4152 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.42 
 
 		 681 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.83 
 
 		 679 aa  757    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.98 
 
 		 702 aa  686    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.61 
 
 		 681 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.46 
 
 		 690 aa  753    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.76 
 
 		 686 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.24 
 
 		 685 aa  771    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 686 aa  1393    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 		 679 aa  744    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.25 
 
 		 683 aa  752    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.13 
 
 		 681 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.66 
 
 		 683 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.78 
 
 		 706 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 681 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.59 
 
 		 687 aa  794    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 		 688 aa  664    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.24 
 
 		 686 aa  739    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 		 678 aa  736    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.22 
 
 		 664 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.97 
 
 		 674 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.41 
 
 		 690 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.16 
 
 		 678 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.03 
 
 		 683 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  71.91 
 
 		 691 aa  975    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.55 
 
 		 695 aa  724    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.68 
 
 		 676 aa  745    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.1 
 
 		 678 aa  761    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 		 682 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.37 
 
 		 678 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.68 
 
 		 703 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 675 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.77 
 
 		 684 aa  668    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.13 
 
 		 681 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.86 
 
 		 675 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  74.37 
 
 		 686 aa  1008    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 686 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 684 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.35 
 
 		 684 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.89 
 
 		 683 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 684 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  48.32 
 
 		 836 aa  615  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 		 531 aa  412  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 		 518 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  45.9 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 523 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  57.87 
 
 		 515 aa  210  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  30.28 
 
 		 491 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 491 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 491 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  29.75 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  30.6 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  30.89 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  30.4 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  29.04 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.35 
 
 		 502 aa  132  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.04 
 
 		 495 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  29.03 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  29.88 
 
 		 510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  31.1 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1014  aldehyde dehydrogenase family protein  28.23 
 
 		 497 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.83 
 
 		 485 aa  129  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.74 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.81 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0956  aldehyde dehydrogenase family protein  27.74 
 
 		 497 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.78 
 
 		 472 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5132  aldehyde dehydrogenase  28.26 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223972  normal  0.0301886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  28.63 
 
 		 476 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  28.83 
 
 		 476 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.4 
 
 		 498 aa  125  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.78 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.96 
 
 		 488 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.55 
 
 		 496 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.55 
 
 		 496 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  26.38 
 
 		 477 aa  124  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  27.93 
 
 		 504 aa  123  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.54 
 
 		 472 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  28.06 
 
 		 475 aa  122  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1286  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 		 490 aa  122  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  29.71 
 
 		 493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.53 
 
 		 500 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 		 490 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  30.75 
 
 		 487 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.63 
 
 		 490 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  29.69 
 
 		 490 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  30.43 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.21 
 
 		 500 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  30.26 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  29.69 
 
 		 490 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  30.94 
 
 		 524 aa  120  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 		 496 aa  120  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 		 496 aa  120  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 		 491 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>