228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3453 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  57.52 
 
 		 262 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  58.56 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  43.02 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  42.64 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  39.77 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  41.92 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  43.11 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  41.92 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  41.54 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  39.62 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  38.98 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  39.46 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  39.69 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  36.15 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  36.12 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  37.12 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  36.88 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  36.74 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  34.47 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  35.61 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  35 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  36.4 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  35.17 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  42.11 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  38.24 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.96 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.12 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.7 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.03 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.35 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.51 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.51 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  30.09 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  31.36 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  27.59 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  33.83 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  32.26 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.56 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.12 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.12 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  30.23 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28.64 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  37.86 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  25.45 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  26.04 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.02 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  34.48 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  23.83 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  40.66 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  29.65 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  36.89 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  44.44 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  29.25 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.55 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  26.63 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  35.75 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.16 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  26.06 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  26.06 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  26.06 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  25.53 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  25.53 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.6 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  33.78 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  33.78 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  29.89 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  33.78 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  33.78 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  27.78 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  33.78 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  27.31 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  33.78 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  30.2 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.13 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  30.28 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  29.38 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  26.6 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  29.38 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  27.52 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  25.93 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>