143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3437 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 416 aa  831    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  70.24 
 
 		 411 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  54.86 
 
 		 415 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  54.29 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  39.57 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  24.12 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  25.67 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  28.48 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  28.48 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  28.48 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  28.48 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  21.23 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  28.48 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  21.23 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  21.7 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  21.7 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  21.7 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  21.7 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  21.23 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  21.23 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  20.75 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.84 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  20.28 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  24.43 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  30.09 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  24.43 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  24.43 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  24.43 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  24.91 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  35.29 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.4 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  22.09 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  27.2 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  27.2 
 
 		 496 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  27.2 
 
 		 496 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  27.2 
 
 		 496 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  27.2 
 
 		 496 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  21.43 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  23.15 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  25.71 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1312  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  24.12 
 
 		 526 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  22.08 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  28.47 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  22.08 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.15 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  25 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  28 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  22.08 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>