More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0799 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0799  ABC transporter related protein  100 
 
 		 353 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2648  ABC transporter related  40 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2416  multiple sugar-binding ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.860941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  33.03 
 
 		 316 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  37.82 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.19 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  37.27 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2162  ABC transporter related  34.12 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.526088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  32.42 
 
 		 312 aa  182  9.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  35.03 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  36.31 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  35.45 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  35.16 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  39.06 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  35.16 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  31.89 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  32.61 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  38.25 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  39.16 
 
 		 632 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.1 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  33.72 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.23 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  33.92 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  33.14 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  35.14 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  31.43 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 337 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.52 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  36.19 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  35 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  35.26 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  33.63 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  38.02 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  34.53 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  35.16 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  38.99 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  35.9 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  36.39 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  35.16 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  31.88 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  38.48 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  40.07 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  36.81 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  35.55 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  34.49 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  32.65 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 353 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  37.19 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0686  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.28 
 
 		 384 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  34.13 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.41 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  36.47 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  33.89 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.6 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  32.57 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  32.08 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  33.43 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0555  ABC transporter related  34.62 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0413767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  35.62 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  33.11 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  35.32 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  34.87 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  35.97 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  32.77 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  33.24 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  32.88 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  34.87 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  34.87 
 
 		 346 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.06 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.65 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  37.96 
 
 		 377 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  32.67 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>