124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19270  histidine kinase  100 
 
 		 486 aa  976    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.413775  normal  0.024183 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  30.1 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.14 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.14 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.33 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 445 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  27.36 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0853  putative signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000112347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  24.66 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 453 aa  53.5  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  28.19 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10700  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  26.03 
 
 		 683 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  23.56 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  27.96 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 575 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  26.82 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  24.39 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  28.96 
 
 		 372 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 799 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 382 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 795 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  35.64 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.17 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 795 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  25.76 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  24.02 
 
 		 364 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3487  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.98 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  22.97 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  23.76 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.82 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  28.24 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.61 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 795 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  27.27 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 795 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  27.09 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.71 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  27.69 
 
 		 369 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  27.18 
 
 		 689 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 379 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  25.97 
 
 		 797 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  27.23 
 
 		 378 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  22.81 
 
 		 595 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  27.66 
 
 		 611 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1248  signal transduction histidine kinase-like protein  27.67 
 
 		 768 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.52923  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  24.68 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  34.57 
 
 		 375 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  36.59 
 
 		 420 aa  47  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  23.61 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  24.77 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  32.98 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  24.61 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  27.02 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  26.61 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.82 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  24.89 
 
 		 799 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  28.57 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  26.86 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  28.57 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  28.57 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.16 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  25.73 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  26.4 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  26.55 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  30.51 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.59 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  25.11 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  28.27 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 638 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  25.94 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  38.24 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4638  putative two-component histidine kinase  30.85 
 
 		 243 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.032763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 723 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>