More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 481 aa  996    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.97 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  32.05 
 
 		 609 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.09 
 
 		 584 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.01 
 
 		 522 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.01 
 
 		 599 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.23 
 
 		 582 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.69 
 
 		 519 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.45 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  27.02 
 
 		 596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.36 
 
 		 596 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.08 
 
 		 597 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  27.18 
 
 		 588 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.81 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  27.6 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  27.02 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  26.81 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  26.81 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.45 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.25 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 589 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.98 
 
 		 583 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  26.3 
 
 		 596 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.5 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.88 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.67 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  27.45 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.46 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  23.75 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  29.17 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.87 
 
 		 596 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.18 
 
 		 591 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.87 
 
 		 596 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  27.36 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.29 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.56 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.64 
 
 		 596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  28.42 
 
 		 517 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.29 
 
 		 1005 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.94 
 
 		 596 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  27.75 
 
 		 598 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  26.71 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.9 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  28.02 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  26.37 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.8 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.44 
 
 		 598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.71 
 
 		 596 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.68 
 
 		 523 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.68 
 
 		 517 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  30.02 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.02 
 
 		 593 aa  133  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.35 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.57 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  27.18 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.78 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  27.31 
 
 		 925 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.06 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.78 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.78 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.78 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.66 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.66 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.66 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  28.41 
 
 		 515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.64 
 
 		 591 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  26.54 
 
 		 957 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.7 
 
 		 589 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.79 
 
 		 597 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  26.98 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  24.7 
 
 		 926 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  26.83 
 
 		 515 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.21 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.56 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  26.68 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  26.62 
 
 		 925 aa  126  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  26.63 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.93 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  28.26 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.12 
 
 		 523 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  28.66 
 
 		 506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  25.54 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  27.25 
 
 		 507 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  27.57 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.18 
 
 		 567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  28.45 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  26.21 
 
 		 507 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.51 
 
 		 566 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  27.73 
 
 		 506 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.57 
 
 		 608 aa  119  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.06 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  27.37 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.19 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  27.13 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1937  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.47 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.5 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  25.95 
 
 		 505 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>