More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1433 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  100 
 
 		 380 aa  781    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.24 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  35.64 
 
 		 479 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.68 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  47.39 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  43.72 
 
 		 465 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.59 
 
 		 474 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  40.93 
 
 		 441 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.01 
 
 		 503 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.98 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.29 
 
 		 490 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.78 
 
 		 472 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.8 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  34.45 
 
 		 473 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  34.45 
 
 		 475 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.17 
 
 		 473 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.65 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  39.68 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  40.08 
 
 		 523 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.86 
 
 		 468 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.05 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  32.56 
 
 		 435 aa  185  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.21 
 
 		 741 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  35.86 
 
 		 448 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.24 
 
 		 513 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.7 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  39.03 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  32.46 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.97 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  32.53 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.87 
 
 		 480 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.49 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  32.14 
 
 		 462 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  33.62 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.62 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.54 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  31.27 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.89 
 
 		 687 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.7 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.7 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  39.22 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  34.63 
 
 		 680 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  34.15 
 
 		 695 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  30.52 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.7 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.07 
 
 		 503 aa  166  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  34.96 
 
 		 676 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  34.55 
 
 		 681 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  31.58 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  31.16 
 
 		 468 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  39.53 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.23 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  30.54 
 
 		 434 aa  162  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  29.94 
 
 		 466 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  30.3 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  30.23 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  32.26 
 
 		 457 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  30.56 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  38.91 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  33.46 
 
 		 690 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  30.56 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  30.56 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  33.6 
 
 		 692 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  30.56 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  37.14 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  29.53 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  29.39 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  28.57 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  36.73 
 
 		 681 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  33.72 
 
 		 665 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  30.9 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.52 
 
 		 569 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.2 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.6 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  30.65 
 
 		 498 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  35.38 
 
 		 674 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.04 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  31.19 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.61 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  38.96 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  29.21 
 
 		 475 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  33.59 
 
 		 699 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  33.09 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  28.93 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  36.51 
 
 		 472 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  33.33 
 
 		 695 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.91 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  33.02 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.44 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  31.98 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  28.99 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  35.98 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.93 
 
 		 471 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  32.82 
 
 		 697 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  35.32 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  32.82 
 
 		 697 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  32.33 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  32.33 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  32.33 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>