181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0716 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  42.12 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  38.8 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  38.26 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  42.28 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  37.63 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  39.53 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  37.29 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  40 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  39.27 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  38.74 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  39.8 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  36.54 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  36.99 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  37.33 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  38.28 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  33.45 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  38.26 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.18 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  32.11 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  31.68 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  29.15 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  29.29 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  28.16 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.63 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  26.56 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  26.56 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  29.93 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  26.73 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.57 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  25.99 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  26.64 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  27.45 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  27.27 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  30.23 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  27.12 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  26.51 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  28.21 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  26.79 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  26.96 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  25.94 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  25.74 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  25.26 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  25.85 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  27.13 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  26.35 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  24.7 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  25.84 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  29.28 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  25.56 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  27.44 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  28.28 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  26.06 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  26.22 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  26.69 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  24.03 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.33 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.11 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  32.65 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  32.65 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  25.99 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  32.87 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  24.19 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  26.27 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  31.29 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  29.65 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  22.68 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.3 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  24.41 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  26.97 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  26.97 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27 
 
 		 457 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  24.05 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  22.98 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  24.05 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  28.39 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  24.1 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  23.2 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.01 
 
 		 462 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  26.4 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  24.24 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  24.24 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.87 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  25.86 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  26.53 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  27.38 
 
 		 454 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  26.37 
 
 		 455 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  27 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  24.5 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.97 
 
 		 464 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  23.68 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  26.99 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  26.53 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.94 
 
 		 524 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  27.08 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  27.08 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  24.79 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  24.22 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>