109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3544 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 149 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  72.17 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  72.17 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  71.3 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  35.61 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00388  putative copper resistance (CopC-like) protein  37.14 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  30.3 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 590 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 564 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 565 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.06 
 
 		 576 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  32.29 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  32.29 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  32.29 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  30.97 
 
 		 519 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  32.38 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  30.17 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  30.17 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  30.17 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  28.32 
 
 		 613 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  30.7 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  34.34 
 
 		 539 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  27.36 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 632 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  30 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  26.79 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  27.56 
 
 		 124 aa  48.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  28.97 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  32.77 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 		 513 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  27.1 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  27.87 
 
 		 217 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  30.1 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  25 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 593 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1977  hypothetical protein  23.36 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  29.29 
 
 		 560 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 869 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  26.79 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.17 
 
 		 578 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  29.52 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  27.03 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  26.55 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  28.46 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 571 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 217 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  26.32 
 
 		 197 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 125 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  22.64 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  25.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>