113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2128 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  100 
 
 
362 aa  757    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  48.69 
 
 
379 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  46.72 
 
 
380 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  46.46 
 
 
380 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  48.04 
 
 
379 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  46.46 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  46.46 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  47.91 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  47.63 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  48.09 
 
 
361 aa  344  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 
359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  37.09 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  43.07 
 
 
336 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  42.95 
 
 
337 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  40.11 
 
 
338 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  42.3 
 
 
336 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  38.76 
 
 
369 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  38.1 
 
 
383 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  33.24 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  38.28 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  38.03 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  33.42 
 
 
363 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  37.14 
 
 
366 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 
371 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  33 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  30.18 
 
 
328 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 
320 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  24.52 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  26.95 
 
 
559 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  25.38 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  22.78 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  22.78 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  23.79 
 
 
467 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  29.24 
 
 
730 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  28.24 
 
 
728 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  27.75 
 
 
792 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  24.89 
 
 
436 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.71 
 
 
742 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  26.71 
 
 
742 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  24.69 
 
 
449 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.15 
 
 
742 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  26.67 
 
 
635 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  29.86 
 
 
730 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.08 
 
 
1305 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  25.12 
 
 
631 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  26 
 
 
720 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
782 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
826 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  26 
 
 
742 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  26 
 
 
742 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  28.15 
 
 
742 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.83 
 
 
742 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26.07 
 
 
507 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  21.59 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26 
 
 
742 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  27.33 
 
 
742 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 
815 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  32.79 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 
822 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  24.31 
 
 
500 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  28.28 
 
 
571 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  28.24 
 
 
862 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  25.81 
 
 
818 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  24.32 
 
 
634 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  27.04 
 
 
681 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  26.95 
 
 
762 aa  49.3  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  29.21 
 
 
749 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  27.14 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  28.45 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  26.83 
 
 
769 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 
806 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.29 
 
 
744 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  26.67 
 
 
890 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  24.55 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  28.65 
 
 
485 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  26.03 
 
 
271 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  26.74 
 
 
633 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.07 
 
 
790 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  26.04 
 
 
736 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
748 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  37.65 
 
 
633 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  25.27 
 
 
763 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  25.93 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 
748 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  36.62 
 
 
673 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  26.71 
 
 
644 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  36.99 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  24.23 
 
 
769 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  25.15 
 
 
800 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.38 
 
 
795 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  21.61 
 
 
453 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  27.06 
 
 
770 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  25 
 
 
644 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  25.15 
 
 
790 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  31.37 
 
 
668 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>