More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2088 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2088  transcriptional regulator domain protein  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.99052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2090  transcriptional regulator domain protein  49.31 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0337  putative response regulator ArlR  32.87 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  30.63 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  29.49 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  27.85 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  27.35 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.03 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  28.25 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  27.19 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1287  two component transcriptional regulator  29.39 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0339445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.35 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  28.29 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.23 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  25.11 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  25.68 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  26.8 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  25.11 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2283  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  25.55 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  29.46 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.34 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0630  two component transcriptional regulator  26.46 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000549408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  24.34 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  24.23 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  24.44 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  23.98 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  26.22 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  26.22 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  25.45 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  24.23 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  25 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.23 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.79 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2615  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.29 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  26.15 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  24.57 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  26.97 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  24.23 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  23.08 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  23.79 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  24.12 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  24.84 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  26.32 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  30 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  30 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.79 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  24.11 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  23.87 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  23.87 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  25.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.99 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  26.58 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  23.42 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  25.56 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  25.53 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1086  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.11 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  29.75 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  26.13 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  23.77 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2150  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  30.97 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.175243  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  23.87 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  27.27 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  25.65 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  23.18 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.65 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  23.66 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  26.13 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  24.11 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.89 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.79 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0416  two component transcriptional regulator  28.78 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  25.21 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.03 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0038  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.69 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.56 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  27.23 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  23.48 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  26.24 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0403  transcriptional activator protein CopR  24.71 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  22.77 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>