More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0630 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0630  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000549408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  76.39 
 
 		 223 aa  341  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 223 aa  237  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  53.21 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.7 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  53.7 
 
 		 223 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  53.24 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  51.61 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 222 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  51.85 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  51.85 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.83 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.38 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  50.47 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.92 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 229 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  49.08 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3779  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  43.52 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  43.12 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2615  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  43.12 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.13 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  42.73 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  48.39 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.73 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  43.58 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2283  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0622  DNA-binding response regulator  43.32 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3692  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0674602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0576  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00494054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3749  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.545663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  46.26 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3875  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000900168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1354  two comoponent transcriptional regulator  49.08 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0615  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0124209  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0650  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000493918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.26 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3294  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.4 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0118223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.26 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.31 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.38 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3006  response regulator receiver protein  43.32 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>