More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2256 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  62.59 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  62.95 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  62.23 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  57.91 
 
 		 277 aa  341  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  50.18 
 
 		 273 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  45.32 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  44.04 
 
 		 273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  48.03 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  48.03 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  48.03 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  46.64 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  43.28 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  36.65 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 430 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  35.19 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  35.59 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  35.02 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  39.34 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  39.34 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  32.83 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  34.39 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  40.28 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  33.07 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  30.24 
 
 		 409 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  38.01 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  38.01 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  38.01 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  38.01 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  34.84 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  36.2 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  33.19 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  34.84 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  30.15 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  36.18 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  30.32 
 
 		 413 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  32.62 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  33.7 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  30.15 
 
 		 410 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  31.95 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.79 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  28.05 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 718 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  25.53 
 
 		 469 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.67 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  25.27 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.03 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  29.12 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.37 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  26.45 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  31.85 
 
 		 724 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  27.61 
 
 		 465 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 353 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  26.97 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  28.89 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  26.64 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.05 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  24.82 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.42 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.73 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>