237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0305 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  98.82 
 
 
170 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  97.06 
 
 
170 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  96.47 
 
 
170 aa  309  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  86.47 
 
 
170 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  77.38 
 
 
170 aa  276  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  75.6 
 
 
170 aa  273  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  76.19 
 
 
170 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  75.6 
 
 
170 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  55.7 
 
 
169 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  49.69 
 
 
178 aa  174  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  48.47 
 
 
181 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  40.71 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  40.59 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  44.32 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  43.75 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  43.48 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  39.13 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  40.35 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  39.34 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6353  hypothetical protein  52.63 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  36.36 
 
 
446 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  33.77 
 
 
230 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  33.88 
 
 
322 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  34.58 
 
 
271 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  33.65 
 
 
336 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  32.46 
 
 
272 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  31.4 
 
 
296 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  36.36 
 
 
289 aa  54.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  33.91 
 
 
316 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.84 
 
 
300 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  31.31 
 
 
295 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  34.69 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  32.52 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.84 
 
 
300 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.04 
 
 
314 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  39.33 
 
 
392 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  34.41 
 
 
277 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  32.46 
 
 
275 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  32.46 
 
 
290 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  32.46 
 
 
275 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  32.46 
 
 
275 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  30.89 
 
 
309 aa  52  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  32.54 
 
 
293 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  36.36 
 
 
294 aa  51.2  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  33.04 
 
 
296 aa  51.2  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  31.09 
 
 
291 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  31.58 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  35.09 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  29.2 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  32.74 
 
 
280 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  31.78 
 
 
272 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  32.06 
 
 
285 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  35.96 
 
 
439 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  31.48 
 
 
305 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  31.96 
 
 
297 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  34.21 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  34.78 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  30.09 
 
 
274 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  26.62 
 
 
313 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  33.04 
 
 
291 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  32.17 
 
 
263 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  31.62 
 
 
299 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  30.71 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  34.04 
 
 
299 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  33.64 
 
 
281 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  33.64 
 
 
281 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  29.69 
 
 
306 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  33.33 
 
 
323 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.63 
 
 
517 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  35.29 
 
 
374 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  35.92 
 
 
370 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  28.32 
 
 
313 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  32.8 
 
 
238 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  35.29 
 
 
372 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  32.06 
 
 
272 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  30.25 
 
 
319 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  30.71 
 
 
649 aa  48.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  35.29 
 
 
373 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  29.58 
 
 
282 aa  47.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  29.2 
 
 
273 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  29.46 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  30.7 
 
 
312 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  34.04 
 
 
285 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  31.43 
 
 
460 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  35.79 
 
 
454 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  32.18 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  34.04 
 
 
824 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  32.08 
 
 
254 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  30.85 
 
 
669 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  31.18 
 
 
271 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  34.02 
 
 
232 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  38.82 
 
 
462 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  29.46 
 
 
244 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.52 
 
 
527 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  30.11 
 
 
271 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  32.46 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  30.33 
 
 
327 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.63 
 
 
741 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>