169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1177 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  46.73 
 
 
879 aa  838    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  71.25 
 
 
896 aa  1386    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  45.8 
 
 
889 aa  787    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.76 
 
 
896 aa  1378    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  70.91 
 
 
896 aa  1365    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  78.41 
 
 
935 aa  1533    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.49 
 
 
884 aa  1122    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.41 
 
 
910 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.6 
 
 
888 aa  1094    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  77.13 
 
 
900 aa  1454    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  97.64 
 
 
932 aa  1828    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.46 
 
 
913 aa  684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.59 
 
 
888 aa  1155    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.28 
 
 
906 aa  1155    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
932 aa  1936    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.3 
 
 
915 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.67 
 
 
853 aa  786    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.06 
 
 
888 aa  1152    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.85 
 
 
913 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  97.75 
 
 
935 aa  1830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  38.5 
 
 
881 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  39.85 
 
 
883 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  37.89 
 
 
883 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  38 
 
 
883 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  37.83 
 
 
891 aa  579  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.83 
 
 
891 aa  579  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.6 
 
 
919 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.41 
 
 
885 aa  558  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.61 
 
 
857 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.08 
 
 
837 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.96 
 
 
837 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.96 
 
 
828 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  35.97 
 
 
856 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  35.97 
 
 
833 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  35.85 
 
 
833 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.45 
 
 
827 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
833 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
833 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 
833 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
833 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.96 
 
 
827 aa  466  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.55 
 
 
827 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  35.78 
 
 
836 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
866 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.3 
 
 
858 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 
863 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.89 
 
 
852 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.71 
 
 
868 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  26.36 
 
 
602 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.85 
 
 
605 aa  214  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  26.16 
 
 
639 aa  210  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  26.16 
 
 
639 aa  207  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  28.85 
 
 
637 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.01 
 
 
779 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.39 
 
 
673 aa  184  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.94 
 
 
636 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.06 
 
 
775 aa  181  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.38 
 
 
613 aa  180  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.92 
 
 
618 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 
766 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.24 
 
 
549 aa  174  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.82 
 
 
634 aa  173  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.42 
 
 
527 aa  173  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  28.85 
 
 
639 aa  171  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.94 
 
 
469 aa  170  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.57 
 
 
655 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.31 
 
 
609 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.22 
 
 
553 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.99 
 
 
834 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.6 
 
 
547 aa  161  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.77 
 
 
772 aa  161  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.78 
 
 
673 aa  160  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.52 
 
 
526 aa  159  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.87 
 
 
534 aa  159  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.75 
 
 
546 aa  158  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.57 
 
 
628 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
525 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.4 
 
 
422 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.9 
 
 
785 aa  151  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.77 
 
 
774 aa  150  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.82 
 
 
505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.07 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.47 
 
 
627 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.57 
 
 
795 aa  147  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.5 
 
 
584 aa  146  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.15 
 
 
816 aa  146  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 
665 aa  145  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 
821 aa  144  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
905 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.77 
 
 
542 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.49 
 
 
765 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.1 
 
 
545 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  26.41 
 
 
543 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.34 
 
 
760 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.14 
 
 
636 aa  138  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.25 
 
 
500 aa  138  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.61 
 
 
639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.77 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.33 
 
 
515 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.4 
 
 
762 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>