More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3382 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  98.16 
 
 		 326 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  98.16 
 
 		 326 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  97.85 
 
 		 326 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  98.16 
 
 		 326 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  100 
 
 		 326 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  97.85 
 
 		 326 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  97.85 
 
 		 326 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  97.24 
 
 		 341 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  97.85 
 
 		 341 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  78.83 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  78.83 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  78.53 
 
 		 326 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  78.53 
 
 		 326 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  78.53 
 
 		 326 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  73.31 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  61.82 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  62.42 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  58.84 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  59.76 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  56.62 
 
 		 374 aa  348  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  56.62 
 
 		 374 aa  348  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  58.24 
 
 		 340 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.31 
 
 		 347 aa  315  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  49.24 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  48 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  46.48 
 
 		 345 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.09 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  49.38 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  46.79 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  47.42 
 
 		 347 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  47.71 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  47.09 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.59 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.01 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  48.32 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.01 
 
 		 345 aa  299  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  47.81 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  46.5 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.01 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.01 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.01 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.01 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  48 
 
 		 349 aa  298  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.5 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  48.01 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  48.01 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  48.01 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.79 
 
 		 344 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  47.71 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  47.4 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  46.88 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  47.84 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  48.28 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  47.11 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  47.81 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  48.28 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  46.46 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.4 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  47.8 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  47.08 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  46.79 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  47.08 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  46.25 
 
 		 347 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  47.84 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  44.95 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  47.19 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  46.2 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.02 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  46.5 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  46.48 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.02 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  46.81 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  44.65 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  45.87 
 
 		 345 aa  288  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  45.32 
 
 		 350 aa  288  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  45.59 
 
 		 345 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  45.76 
 
 		 347 aa  288  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  47.04 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  47.04 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  46.06 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  46.56 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  45 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.94 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  46.48 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  46.97 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  47.02 
 
 		 347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  42.73 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  47.34 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  45.76 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  44.51 
 
 		 365 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  44.71 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  45.87 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  45.57 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  45.26 
 
 		 344 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  45.26 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  45.26 
 
 		 344 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  44.65 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  44.95 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  44.68 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  46.54 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>