More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1117 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  57.92 
 
 
267 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 
269 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
256 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 
267 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
277 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
274 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 
263 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 
282 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
254 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
256 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  41.88 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
296 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.2 
 
 
249 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  33.72 
 
 
258 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 
269 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  31.54 
 
 
273 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.09 
 
 
308 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.09 
 
 
308 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
308 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 
285 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
308 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
280 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
246 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
308 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
298 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  31.68 
 
 
273 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.97 
 
 
246 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
315 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
262 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 
271 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.49 
 
 
246 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.24 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.1 
 
 
302 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.1 
 
 
302 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.75 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.75 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  32.75 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 
269 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.75 
 
 
302 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.75 
 
 
302 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.8 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.86 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
300 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
270 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
250 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.22 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
251 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 
295 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
307 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.87 
 
 
246 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
311 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.87 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
184 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
258 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.53 
 
 
244 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  37.63 
 
 
295 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
281 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  37.04 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>