More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0104 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 219 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  85.45 
 
 		 220 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  82.16 
 
 		 223 aa  361  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  73.71 
 
 		 219 aa  320  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.06 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1322  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.59 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.307834  hitchhiker  0.00000000745159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.22 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  68.54 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  67.45 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.45 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.79 
 
 		 227 aa  284  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.28 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.36 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.76 
 
 		 225 aa  275  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.42 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.02 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4340  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.3 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0991  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.73 
 
 		 234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0361  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 226 aa  271  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0350  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 		 226 aa  271  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.027158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1771  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.55 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.28 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.62 
 
 		 225 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0932  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1198  Ribulose-phosphate 3-epimerase  68.9 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00622607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.1 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.11 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.11 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0532  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.01 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.26 
 
 		 221 aa  264  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.26 
 
 		 221 aa  264  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  65.07 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.11 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.62 
 
 		 221 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3756  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.56 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.5 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.26 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1510  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.17 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000472426  decreased coverage  0.0000666279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.26 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 		 225 aa  258  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3899  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.87 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.97 
 
 		 223 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.62 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0494  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.66 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.45 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.6 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 		 235 aa  255  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  63.45 
 
 		 224 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.74 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 		 221 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.68 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 		 225 aa  252  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 234 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 234 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62 
 
 		 236 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  62 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.31 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.84 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.22 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0438  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.82 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3660  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.36 
 
 		 230 aa  250  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  59.07 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.21 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0856  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1512  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.659208  normal  0.0217297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.6 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0587  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.27 
 
 		 226 aa  247  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.09 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.74 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1614  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 		 231 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.987779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  61 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.15 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.79 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.09 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>