More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4506 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  100 
 
 
501 aa  974    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  82.75 
 
 
517 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  31.51 
 
 
432 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.86 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.79 
 
 
340 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  45.38 
 
 
459 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.33 
 
 
329 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.71 
 
 
321 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  50.94 
 
 
162 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
394 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  33.86 
 
 
306 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
315 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
392 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.58 
 
 
236 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  50.47 
 
 
398 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  45.53 
 
 
308 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
337 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.44 
 
 
332 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  45.97 
 
 
367 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.46 
 
 
176 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.01 
 
 
235 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
342 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.67 
 
 
210 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.74 
 
 
438 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  44.92 
 
 
337 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  43.51 
 
 
447 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  49.52 
 
 
350 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.68 
 
 
331 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  50 
 
 
452 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
374 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.46 
 
 
531 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
160 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.15 
 
 
366 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
347 aa  94  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  40.78 
 
 
337 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.2 
 
 
230 aa  91.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
345 aa  91.3  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
374 aa  91.3  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  47.17 
 
 
319 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  36.72 
 
 
249 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  31.06 
 
 
283 aa  90.5  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  41.8 
 
 
340 aa  90.5  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.8 
 
 
222 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  31.06 
 
 
283 aa  90.1  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
234 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
347 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  35.94 
 
 
257 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  35.94 
 
 
269 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  31.06 
 
 
283 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.98 
 
 
333 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  35.94 
 
 
249 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  39.06 
 
 
178 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  35.94 
 
 
269 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  35.94 
 
 
249 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  40.19 
 
 
173 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
326 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
208 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  46.24 
 
 
350 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.45 
 
 
475 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
278 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
284 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  38.85 
 
 
173 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  35.25 
 
 
273 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  35.25 
 
 
273 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  35.25 
 
 
273 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  35.25 
 
 
273 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  41.9 
 
 
333 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  35.25 
 
 
273 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.28 
 
 
388 aa  87  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  35.94 
 
 
249 aa  87  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.11 
 
 
198 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.68 
 
 
366 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
177 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  37.07 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  39.53 
 
 
181 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  40.8 
 
 
273 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.87 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
256 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
180 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  33.61 
 
 
275 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  40 
 
 
234 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
231 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42.48 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  39.06 
 
 
177 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  38.76 
 
 
181 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  31.97 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.78 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  41.9 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  30.07 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.06 
 
 
177 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  39.06 
 
 
177 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  33.61 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>